為明確外貿(mào)企業(yè)使用經(jīng)稅務機關(guān)審核允許納稅人抵扣其進項稅額的增值稅專用發(fā)票如何辦理出口退稅問題，稅務總局制定了《國家稅務總局關(guān)于外貿(mào)企業(yè)使用增值稅專用發(fā)票辦理出口退稅有關(guān)問題的公告》（以下簡稱《公告》），現(xiàn)將《公告》解讀如下：
　　一、《公告》制定目的
　　近年來，為保障納稅人權(quán)益，稅務總局相繼下發(fā)了《國家稅務總局關(guān)于修訂<增值稅專用發(fā)票使用規(guī)定>的通知》(國稅發(fā)[2006]156號)、《國家稅務總局關(guān)于印發(fā)＜增值稅專用發(fā)票審核檢查操作規(guī)程（試行）＞的通知》（國稅發(fā)[2008]33號）、《國家稅務總局關(guān)于失控增值稅專用發(fā)票處理的批復》（國稅函[2008]607號）和《國家稅務總局關(guān)于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》（2011年第50號）等文件，進一步明確了以下幾類特殊情形增值稅專用發(fā)票經(jīng)主管稅務機關(guān)審核允許納稅人申報抵扣其進項稅額：一是丟失已開具增值稅專用發(fā)票，二是失控增值稅專用發(fā)票，三是增值稅專用發(fā)票稽核比對結(jié)果屬于異常的增值稅專用發(fā)票，四是逾期認證增值稅專用發(fā)票。
　　比照允許抵扣增值稅專用發(fā)票可辦理出口退稅，稅務總局此前也已在相關(guān)出口退稅管理文件《稅務總局關(guān)于外貿(mào)企業(yè)丟失增值稅專用發(fā)票抵扣聯(lián)出口退稅有關(guān)問題的通知》（國稅函[2010]162號）和《國家稅務總局關(guān)于銷貨方已經(jīng)申報并繳納稅款的失控增值稅專用發(fā)票辦理出口退稅問題的批復》（國稅函[2008]1009號）對前兩種特殊情況下企業(yè)丟失增值稅專用發(fā)票、失控增值稅專用發(fā)票可辦理退稅問題予以明確?？紤]到目前出口退稅管理文件對其他兩類特殊情形增值稅專用發(fā)票可辦理退稅情況也應予以明確，稅務總局制定了《公告》。
　　二、《公告》的主要內(nèi)容
　　一是明確了外貿(mào)企業(yè)可使用經(jīng)稅務機關(guān)審核允許納稅人抵扣其進項稅額的增值稅專用發(fā)票做為出口退稅申報憑證向主管稅務機關(guān)申報出口退稅。
　　二是對外貿(mào)企業(yè)辦理出口退稅提供經(jīng)稅務機關(guān)審核允許納稅人抵扣其進項稅額的增值稅專用發(fā)票的具體申報要求予以明確。
　　三是考慮到《公告》中允許抵扣的增值稅專用發(fā)票的允許抵扣資料為稅務系統(tǒng)內(nèi)部資料，要求各地稅務機關(guān)審核外貿(mào)企業(yè)出口退稅時要認真審核增值稅專用發(fā)票并核對稅務機關(guān)內(nèi)部允許抵扣資料，在出口退稅審核系統(tǒng)中比對增值稅專用發(fā)票稽核比對信息、審核檢查信息和協(xié)查信息，在增值稅專用發(fā)票信息比對無誤的情況下，按現(xiàn)行出口退稅規(guī)定辦理出口退稅事宜。
　　四是規(guī)定本公告自2012年６月1日起施行。本公告施行前外貿(mào)企業(yè)取得的經(jīng)稅務機關(guān)審核允許納稅人抵扣其進項稅額的增值稅專用發(fā)票申報辦理出口退稅的，按照本公告規(guī)定和現(xiàn)行出口退稅規(guī)定辦理出口退稅事宜。